Identifiers and Description

Gene Model Identifier

SteCoe_5081

Standard Name

None

Aliases

None

Description

RNA_pol_Rpb1_1 domain protein

Genome Browser

GBrowse

Gene Ontology Annotations

Molecular Function

Biological Process

Domains

Gene Expression Profile

No expression data available at this time.

Homologs

SourceIdentifierScoreDescription
Oxytricha TrifallaxContig18775.0.g490RNA polymerase Rpb1, domain 5

WormBaseWBGene000001230

General Information

No Data fetched for General Information

Associated Literature

No Data fetched for Associated Literature

Sequences

>SteCoe_5081(Protein)
MLKSGSAFTPSIAEVHKVTGVSFGILRPDEIEAMSADTITHTDIYDDEGKPKDQGVNSLL
MGTNDNLLQCKTCNGRKNDCPGHFGHIKLAKPVYHFGFLNEIRRVLRSVCFNCSRLLLSH
SDPRFQTAVKIKNPKARGKQLYKICEGIKKCPTAQGEKEADEDNEEGNFGGCGKIQPKII
RDGIGLVVEYNEAVDDQPDRKRRLNAEDALKILKGVSDVDCEALGFDPARSRPDWMIVQV
LPVAPPCVRPYVVLDSTLRSEDDLTHQYTQILKTNNKLANEIERGSPQHLINQDIMVLQF
HVATLFNNEIPGQPQAKHRSGKPIKSISQRLKGKEGRIRGNLMGKRVDFSARTVITPDPN
LSLDQLGVPRSIALNLTIPETVTHFNMEKMKILVDNGPAMHPGAKYIIRSDGSIIDLKYV
RRHTELHLEYGYKVERHITNGDFVIFNRQPSLHKMSMMAHSVVILPYSTFRLNLSVTTPY
NADFDGDEMNMHVPQSLETKAELTEIMHVPKQIVSPQSNRPVMGVVQDSLLGVSLFTRRD
MFLELHEVMNLLMWIDNFNGRLPVPCVLKPRPLWTGKQIFSLLLPEVNLTRYSSTHDGDK
DSSSRDTEVLIEKGELLTGIVDKRTVGSSSGSLIHVIWMEHGPMHTKDFLSRCQKVVNNW
LLMHSFSVGISDTITESSSIDNIRQTLSTAKGKIIKLINQAREGKIPCQPGKNMMESFEF
KVNTKLNAARDKSGELATKSLSFRNRVKAMVNAGSKGSEINICQIMACVGQQNVEGRRIP
FTFMKRTIPHFGKDDYGPESRGFVENSYISGLTPQEFFFHAMGGREGLSDTAVKTSETGY
IQRRLMKALEDVMVKYDGTVRNSAGNILQFLYGEDGMAGEYIEDQVLETLKLDYESLKKN
YEFLDPNEDPEICLDKYRGAIESYVISEIVRRPDQQVRLMQEFKKIVEDQKELRVIFTNY
DDRQHLPVNLKRLIWNAKKKFGISGLNRSDLHPVKVIDSLEGLGKKLKVISGFNKSEYEN
DNNATMLFNIHLRSLLSSKRTIVKERLTEEAFEWLLGEIESRFSQAKTQPGEMVGSIAAQ
SLGEPATQMTLNTFHFAGVSSKNVTLGVPRLKEIINVAKNIKTPSLNVYLQNDFASSSDY
AKEILSKLEYTTLGNVTEACEIYYDPDPVRTIIEEDAELVENYFEMPDEGIEIDKMSPWL
LRIELNKIAMIDKNITMHDIHDKITQEYPNELHCIYSDDNDEKLILRLRIMNDEENTVQD
EQLSKWKFLKDLEGAMLQDLWLKGIEGISKVVMKEVNVCSIGSDGGIRRNKHWRLETDGV
NLRAVLALEGIDHTKTISNDLIEVANILGIEAVRQALMKELREVLNVYGIYVNYRHLSIL
CDVITQRGYLMSITRHGINRTECGPLHKASFEETVEMLLEASAYSEVDFLKGVTESIMLG
QLAPIGTGEIDVLIDAEKIEHAQTIYDPLEVPEMLDYPTNKYPAEGAQGTPINVATPRVI
MPDSTAATTPRAETPGNNANFSPWEYAPSPASHASPFVRYSPVIHSPMYAHTPSMVQSPN
YAGSIPSYSPSNNSMRPFSPYGITSPTVAVAISPKMQNYPSPYYSPSHPGYSPSSPAYSP
TSPAYSPTSPAYSPTSPAYSPTSPAYSPTSPAYSPTNAYSPNVPSPAYKPTPYVPSPVYN
PRSPAYNSASPKIAQQVIVSKTETIEEDEDDEEEVSN


>SteCoe_5081(CDS)
ATGCTAAAATCTGGTAGTGCGTTTACACCTTCAATAGCCGAAGTCCATAAAGTGACTGGG
GTAAGTTTTGGAATCCTCCGTCCAGATGAAATTGAAGCTATGTCTGCTGATACAATAACC
CATACAGACATTTATGATGATGAAGGAAAGCCTAAAGACCAAGGCGTAAATAGTCTTTTA
ATGGGAACAAATGACAATTTGTTACAATGTAAAACTTGTAATGGGCGGAAGAATGACTGC
CCAGGACATTTTGGCCATATCAAACTTGCTAAACCAGTGTATCATTTCGGCTTCCTTAAT
GAAATCAGACGGGTATTACGATCTGTATGTTTCAATTGTTCAAGACTTCTTCTTAGCCAT
AGTGATCCACGTTTCCAAACAGCTGTAAAAATCAAAAACCCTAAAGCTCGAGGTAAACAA
TTATATAAAATATGTGAAGGGATAAAAAAATGCCCAACAGCTCAAGGAGAAAAAGAAGCA
GACGAAGATAACGAAGAAGGGAATTTTGGTGGATGTGGCAAAATCCAACCAAAAATCATA
AGAGATGGTATAGGATTAGTTGTAGAATATAATGAAGCTGTTGATGATCAGCCTGATAGA
AAAAGACGTTTGAATGCTGAAGATGCTTTGAAAATATTAAAAGGGGTTTCTGATGTTGAT
TGTGAAGCTTTAGGATTTGATCCTGCCCGCTCGCGACCAGACTGGATGATTGTCCAAGTG
CTTCCAGTTGCCCCTCCTTGTGTCCGTCCATATGTGGTTTTAGATTCAACATTGCGTAGT
GAGGATGATTTAACCCATCAATATACTCAGATATTAAAAACTAATAACAAATTAGCAAAT
GAAATTGAAAGAGGATCACCACAGCATCTTATAAATCAAGACATTATGGTCTTACAATTC
CATGTAGCTACACTTTTTAATAATGAAATCCCAGGACAACCTCAAGCTAAACATAGATCA
GGAAAACCAATAAAAAGTATCAGTCAAAGGCTTAAAGGTAAAGAAGGGAGGATTAGAGGA
AATCTTATGGGAAAAAGAGTTGATTTTTCTGCTAGAACTGTGATTACCCCAGATCCTAAT
TTAAGCTTAGATCAATTAGGTGTCCCTAGATCCATAGCACTTAATCTAACTATTCCAGAA
ACAGTCACACATTTTAATATGGAAAAGATGAAAATTCTTGTTGATAATGGACCAGCTATG
CACCCTGGAGCTAAATATATAATCCGTTCTGATGGGAGTATAATTGACTTAAAATATGTT
AGAAGACATACAGAGCTTCATTTAGAATATGGGTATAAAGTTGAAAGACATATCACAAAT
GGAGATTTCGTTATTTTTAACAGACAACCTTCTTTACATAAAATGTCGATGATGGCCCAT
TCTGTTGTAATTTTGCCTTATTCGACTTTTAGATTGAATTTATCAGTGACAACACCTTAT
AATGCTGATTTTGATGGAGATGAAATGAATATGCATGTTCCACAAAGCTTAGAAACTAAA
GCTGAACTTACAGAAATAATGCATGTGCCTAAACAGATTGTCTCGCCACAAAGTAATAGA
CCTGTTATGGGTGTTGTTCAGGATTCATTACTTGGGGTATCATTGTTTACTAGAAGGGAT
ATGTTTTTAGAGCTTCATGAGGTTATGAATTTGCTTATGTGGATTGATAATTTTAATGGA
AGGTTACCAGTTCCTTGTGTATTAAAGCCAAGACCTTTATGGACTGGGAAACAGATTTTT
TCGCTTTTGTTGCCGGAGGTTAATTTGACAAGATACTCATCAACTCATGATGGGGATAAG
GATTCTTCAAGTAGAGATACGGAGGTTTTGATTGAAAAAGGAGAACTATTGACTGGGATT
GTGGATAAAAGAACTGTTGGGTCATCTTCTGGCTCACTTATACATGTTATATGGATGGAA
CATGGTCCTATGCATACTAAAGACTTCTTATCTCGCTGCCAAAAAGTTGTCAACAACTGG
CTTCTTATGCATTCTTTTAGTGTTGGGATCAGTGATACCATAACTGAGTCATCATCAATT
GACAACATCAGACAAACTCTTTCAACAGCCAAAGGGAAAATCATCAAACTTATAAACCAA
GCACGTGAAGGCAAAATCCCATGTCAACCAGGTAAAAATATGATGGAAAGCTTTGAGTTC
AAAGTTAACACAAAACTCAATGCTGCTCGTGATAAATCAGGTGAATTAGCAACAAAAAGT
TTAAGTTTCAGAAATCGTGTCAAAGCTATGGTAAATGCAGGGTCAAAAGGTTCTGAAATA
AACATCTGTCAAATCATGGCTTGTGTAGGTCAACAAAATGTTGAAGGTCGAAGAATTCCA
TTTACTTTTATGAAAAGGACAATCCCACATTTTGGTAAAGACGACTATGGTCCTGAATCA
AGAGGTTTTGTAGAAAATTCTTATATATCAGGTTTAACACCACAAGAGTTTTTTTTTCAT
GCTATGGGTGGTAGAGAAGGTTTAAGTGATACAGCTGTAAAAACTAGTGAAACTGGGTAT
ATACAAAGACGTCTTATGAAAGCATTAGAGGATGTTATGGTAAAATATGATGGGACAGTT
AGAAACTCTGCAGGAAACATTTTACAGTTTTTATATGGAGAAGATGGTATGGCAGGAGAA
TATATCGAAGATCAGGTTTTAGAAACTTTGAAACTGGATTATGAAAGTTTAAAGAAAAAT
TATGAATTTCTTGACCCTAATGAAGACCCTGAGATATGTTTAGATAAATATAGAGGGGCT
ATAGAAAGTTATGTTATAAGTGAAATTGTTAGAAGACCAGATCAGCAGGTAAGATTGATG
CAAGAGTTTAAGAAAATTGTTGAGGACCAAAAAGAACTCAGGGTTATTTTTACTAATTAT
GACGATAGGCAGCATTTACCTGTAAATCTTAAAAGGCTTATTTGGAATGCAAAGAAAAAA
TTCGGGATTTCTGGACTGAACCGAAGCGACTTGCACCCTGTAAAAGTTATTGACAGCCTA
GAAGGTTTAGGAAAAAAACTTAAAGTTATATCTGGGTTTAATAAAAGTGAATATGAAAAC
GACAATAATGCAACAATGCTTTTTAATATCCATTTACGGAGTTTATTAAGTTCAAAAAGA
ACTATAGTCAAAGAACGACTGACTGAAGAAGCTTTTGAATGGTTACTTGGGGAAATAGAA
TCAAGGTTTTCACAAGCAAAAACTCAACCTGGAGAAATGGTTGGTTCTATAGCCGCTCAA
TCTTTAGGTGAACCTGCAACTCAGATGACTTTAAATACTTTTCACTTTGCAGGAGTTTCA
TCAAAAAACGTAACTTTAGGTGTCCCAAGATTAAAAGAAATAATCAATGTGGCTAAAAAC
ATAAAAACTCCATCATTAAATGTTTATTTACAAAACGATTTTGCTTCAAGTTCTGATTAT
GCTAAAGAAATACTAAGTAAACTTGAATATACAACCTTAGGCAATGTAACTGAAGCTTGT
GAAATTTATTATGACCCTGACCCTGTGCGGACTATAATAGAAGAAGATGCTGAACTTGTT
GAAAATTATTTTGAAATGCCAGATGAAGGTATTGAAATAGATAAAATGTCCCCATGGTTG
TTACGTATTGAATTAAATAAAATTGCTATGATTGATAAGAATATTACAATGCATGATATA
CATGATAAAATAACTCAAGAATATCCAAATGAACTTCATTGTATATATTCTGATGATAAT
GATGAGAAACTTATATTAAGACTTAGAATTATGAATGATGAAGAAAATACAGTACAAGAT
GAACAGCTTTCTAAATGGAAATTCTTAAAAGATCTTGAAGGAGCGATGTTACAGGATTTA
TGGCTTAAAGGGATTGAAGGGATATCTAAAGTTGTTATGAAAGAAGTTAATGTATGTAGT
ATAGGTTCAGATGGGGGGATAAGAAGGAATAAGCATTGGAGACTTGAAACTGATGGGGTA
AATCTGCGAGCTGTACTTGCACTTGAAGGTATTGATCATACAAAAACGATTTCTAATGAT
CTGATTGAAGTTGCTAATATATTAGGTATTGAAGCAGTAAGACAAGCATTAATGAAAGAA
CTTCGTGAAGTATTAAATGTATATGGGATTTATGTGAATTATAGGCATTTATCAATATTA
TGTGATGTTATAACACAAAGAGGGTATTTGATGAGTATAACACGTCATGGGATAAACAGG
ACAGAATGTGGACCTTTACATAAAGCATCATTTGAAGAAACTGTAGAAATGCTTTTAGAA
GCCTCAGCGTATTCTGAAGTGGATTTTTTAAAAGGAGTCACAGAAAGTATTATGCTTGGT
CAATTAGCTCCGATAGGCACAGGAGAAATTGATGTGTTGATTGATGCTGAAAAAATCGAG
CATGCACAAACTATATATGACCCACTTGAAGTACCAGAAATGCTTGACTACCCAACGAAT
AAATATCCAGCAGAAGGTGCTCAAGGGACTCCAATTAATGTAGCAACACCTAGGGTAATA
ATGCCAGATAGTACTGCGGCAACTACACCAAGGGCAGAAACTCCAGGGAATAATGCGAAT
TTTTCTCCTTGGGAATATGCTCCAAGTCCTGCTAGTCATGCATCTCCTTTTGTCAGATAC
TCACCTGTTATTCATTCACCAATGTATGCTCATACACCTAGTATGGTTCAAAGCCCTAAT
TATGCTGGTTCAATACCTAGTTACTCTCCTTCAAATAATAGCATGAGACCTTTTAGTCCA
TATGGTATCACTAGTCCTACTGTTGCTGTTGCCATAAGCCCTAAAATGCAAAATTACCCT
AGTCCTTATTATTCACCTTCACATCCTGGGTATTCACCTTCATCACCTGCTTATTCACCT
ACATCACCAGCTTATTCACCTACATCACCGGCTTATTCTCCTACATCACCAGCTTATTCA
CCTACATCACCTGCTTATTCACCTACATCACCTGCTTATTCTCCTACAAATGCTTATTCA
CCAAATGTTCCATCACCTGCTTATAAACCTACACCTTATGTACCTAGTCCTGTTTATAAT
CCTAGAAGTCCAGCTTATAATTCTGCATCACCTAAAATTGCCCAACAAGTTATTGTTTCT
AAGACTGAAACTATTGAAGAAGATGAGGATGATGAAGAAGAAGTTAGTAACTAG